此后，显宗为了牵制西人，逐渐起用许积等南人，于康熙十年（1671年）拜许积为领议政，此举遭到以宋时烈、宋浚吉为首的西人反对，虽然许积被迫辞退领议政，但西人党也有多人被显宗治罪。

康熙十三年（1674年）二月，孝宗遗孀孝肃王大妃张氏（仁宣王后）去世，而慈懿大王大妃仍然健在，于是又围绕她如何为仁宣王后服丧的问题而发生“甲寅礼讼”。西人主张按她为孝宗服丧的期年服减一等，行大功服（服丧九个月）。七月，南人地盘庆尚道的一个叫都慎征的儒生上疏反对，主张将仁宣王后视为“长妇”，按“国制”应行期年服（《经国大典》规定母亲为长子妻行期年服、为众子妻行大功服）。当时，西人也不是铁板一块，内部还存在“山党”和“汉党”的宿怨，其中“汉党”人物金锡胄是显宗的妻舅，他支持南人的主张，显宗也为了维护父母的地位，在这次礼讼中采取南人提出的期年服。于是出身西人的领议政金寿兴被流放春川，许积再度出任领议政，仁祖反正以来持续五十年的西人政权也随之垮台，开启了短暂的南人当权的时代。

康熙九年（1670年，庚子年）和康熙十年（1671年，辛丑年），朝鲜曾爆发大饥荒，造成140余万人非正常死亡，史称“庚辛大饥馑”，其严重程度在整个朝鲜王朝时期仅次于20多年后的“乙丙大饥馑”。除此之外，显宗年间的朝鲜社会尚属稳定。

显宗体弱多病，顺治十七年（1660年）曾失明将近一年，群臣奏事不用文书，只能面禀，导致人心惶惶。康熙八年（1669年），显宗左下颌长了一个瓶子大小的瘤子，医官用针灸抽出脓水达一升之多。康熙十三年（1674年）八月，显宗身体非常疲倦，连续饮用人参茶之后，身体如火球般发热。多日针灸治疗无效，于八月十八日（9月17日）亥时升遐于昌德宫养心阁（斋庐），时年三十四岁。群臣上庙号显宗，谥号纯文肃武敬仁彰孝大王（英祖加谥“昭休衍庆敦德绥成”），清朝赐谥“庄恪”，朝鲜内部不用。葬于崇陵。世子李焞继位，是为肃宗。

显宗年间，西人党和南人党之间的朋党之争渐起，表现为他刚即位和去世前分别发生的两次“礼讼”。两个党派之间的斗争，实际上是显宗与宋时烈的纠葛。己亥礼讼后，显宗逐渐排折西人，提拔南人。以金佑明、金锡胄为首的清风金氏在孝宗就反对宋时烈，在甲寅礼讼中，他们极力倡导孝宗嫡长子说，并与南人结成结盟，形成倒宋的政治力量。显宗最终在甲寅礼讼中支持南人，结束了仁祖反正以来持续五十年的西人政权。

显宗年间，继续推进之前三朝所实施的赋税制度“大同法”，于康熙元年（1662年）将大同法覆盖到全罗道内陆地区，康熙五年（1666年）在咸镜道实施大同法，减轻了两地农民的负担。在咸镜道推行大同法时，由于该道土地贫瘠，每邑情形不同，故因地制宜，按各邑实际情况分配不同税额，是为“大同详定法”。

朝鲜王朝虽然禁止同姓近亲结婚，但如果相同姓氏而本贯不同，依然允许通婚。康熙八年（1669年），显宗采纳宋时烈之建议，禁止同姓异贯结婚，即彻底禁止同姓结婚。

显宗年间，书院比较发达，任内新设书院70所，其中国王赐匾额者43所，年均新增数量和国王赐额数量均超过前代。

显宗在事实上放弃了被父亲孝宗定为国是的“北伐论”，对清态度相对更加务实，除了康熙五年（1666年）因朝鲜藏匿丙子胡乱时被俘、后逃回朝鲜的安秋元一事而使显宗被罚银5000两外，两国关系总体稳定。康熙六年（1667年），有台湾明郑官商林寅观等在赴日本途中漂流到朝鲜济州岛，显宗惧怕得罪清朝，便把这95人扭送清朝，结果全部被杀。弘文馆副提学闵鼎重批评显宗没有执行孝宗定下的对“漂汉”（汉人漂流民）的保护政策。显宗亦感到后悔，于翌年二月下令将所有漂流到朝鲜的遇难船只就地遣返，以免此类悲剧重演。康熙九年（1670年），济州岛又出现“漂汉”，这次显宗就把他们送到日本。

康熙十二年（1673年），因康熙帝下令撤藩，平西王吴三桂举兵反清，“三藩之乱”爆发，蒙古察哈尔部亦不稳。次年三月，清朝内乱的消息通过燕行使传入朝鲜，朝鲜上下忧虑不安，担心清朝要求朝鲜出兵助剿，但同时也有许多反清士人为之振奋，认为“北伐”的天赐良机已至，遂有康熙十三年（1674年）五月儒生罗硕佐、赵显期请求练兵囤粮，以备“复仇雪耻”，七月又有南人尹鑴秘密上疏，请求显宗响应吴三桂与蒙古，兴师北伐。但显宗都不予答复。不仅如此，显宗还决定以灵慎君李滢为陈慰使，出使清朝，以打消清朝疑虑。不久，显宗病故，康熙帝认为显宗对清朝忠诚可嘉，为笼络朝鲜，特地在常规赐祭外加祭一次。

显宗还是世子时，有一个内侍进献捕禽兽器械，百般献媚，显宗非常喜欢，令其他内侍望尘莫及。等到显宗即位后，人们都以为这个内侍会专权宫中，然而显宗却以“巧佞”为由斥退他，于是这个内侍终身不能再接近显宗。

显宗非常仁慈，甚至对待动物也是如此。孝宗年间，有人向宫廷献了只小熊，后来小熊渐渐长大，内侍们都劝孝宗杀掉此熊，以免后患，孝宗打算听从，显宗听到后急忙劝阻，说熊还没有害人就先杀了它，实在不是仁人之心，请求放到深山里。孝宗大喜，说：“你当了国王后，一定不会因猜疑杀人，做你臣下的人算是有福了！”其后显宗做了十五年国王，果然没冤杀一人。

显宗在位时，一个叫全以性的内侍曾在禁苑射中野鸭的一只脚，野鸭断脚后，仍常栖身于禁苑中。显宗看到这个独脚野鸭，非常怜悯，询问缘由，内侍如实告知，显宗更加伤感，“天颜不怡者良久”。以后每次看到这个野鸭都是这样。

显宗曾召见自己的外甥们，赐给黄柑，并说：“你们今天吃这些柑子，将来不要搞朋党之论，就算是报答了！”由此可见显宗对朋党的深恶痛绝。

（以上参考资料）

《列圣御制》中收录显宗诗2首（《暮春》、《别青平尉之燕京》）、文1篇（《自温泉冒雨还宫书赐东平尉》）。

显宗死后，与明圣王后合葬于崇陵。该陵位于今韩国京畿道九里市，属于东九陵之一，崇陵的丁字阁是朝鲜王陵丁字阁中唯一留存下来的八作屋顶的丁字阁。