又过了很久，宇文泰赞美李穆的志气节操，赞叹道：“人所宝贵的，只有自己的生命，李穆能看轻自己生命，把我从危难中救出。即使再给他封爵升官，赏赐玉器绸缎，也难以报答。”因此赐李穆以铁券，饶恕他十次死罪。

不久，李穆开府治事，兼领侍中之职。当初，邙山败北，李穆将骢马授给宇文泰，宇文泰于是将厩内的骢马全部赐给李穆，并封李穆的姐妹为郡君、县君，他的本宗以及母舅家，也皆得到各种赏赐。

李穆转任太仆后，跟随于谨攻破江陵，增加食邑一千户，进位为大将军。进击并打破了曲沔蛮，被授为原州刺史，宇文泰另拜授李穆嫡子李惇为仪同三司。李穆考虑到两位兄长李贤、李远都是佐命功臣，而子弟许多都担当要职，李穆担心过于盈满而深感恐惧，因此坚辞不受，但宇文泰不允许。不久李穆迁任雍州刺史，兼任小冢宰。

北周元年（557年），李穆增加食邑三千户，连同以前的共三千七百户。宇文泰又另封李穆的一个儿子为升迁伯，李穆让爵于他的兄长之子李孝轨，宇文泰同意了。

宇文护执政时，李穆之兄李远及李远之子李植，因谋害摄政晋公宇文护，全部被杀，李穆应当坐罪。在此之前，李穆知道李植不是可以保家之人，多次劝李远除掉他，李远却不接受。等到临刑受死时，李远哭着对李穆说：“显庆，我不听你的话，以至落到这个地步，这可怎么办！”李穆因此免于一死，除名被贬为民，他的子弟也都被罢免官职。

李植之弟淅州刺史李基，本应连坐被杀，李穆请求用自己的两个儿子换回李基的性命，宇文护认为李穆仁义而释放了他们叔侄三人。不久，宇文护拜授李穆为开府仪同三司、直州刺史，并恢复李穆安武郡公的爵位。

武成年间（559年-560年），李穆被免除官爵的子弟，全部恢复官爵。

武成二年（560年），李穆被任命为少保。

保定二年（562年），升任大将军。

保定三年（563年），李穆随杨忠东征，回来后又拜授小司徒。

保定四年（565年）五月，进位柱国，改任大司空，并奉诏修筑通洛城。

天和年间（566年-572年），李穆晋爵位为申国公，持节安抚东境，修武、申、旦、郛、慈涧、崇德、安民、交城、鹿卢等城镇。

建德元年（572年），拜授太保。建德二年（573年），出任原州总管。

建德四年（575年），高祖（周武帝）东征，命令李穆率领三万兵马，另外进攻轵关和黄河以北各县，李穆将其全部攻占。后来因为周武帝生病而撤军，又将这些地方放弃。

建德六年（578年），进位上柱国，转任并州总管。当时东部地区是第二次平定，人心不安，李穆治理，以清静为旨，百姓感激。

大象元年（579年），增加食邑至九千户，拜授大左辅，保留并州总管原任。

大象二年（580年），加官至太傅，总管不变。

杨坚做北周宰相时，外戚太师蜀国公尉迟迥作乱造反，派人招李穆。李穆扣留其使者，把联络造反的书信上交朝廷。李穆之子李士荣，认为李穆驻防之地有国家精锐部队，私下劝李穆造反。李穆心怀犹豫，杨坚派柳裘和李穆的第十子李浑前去开导晓喻。柳裘见到李穆，晓以利害，李穆听后十分高兴，说道：“周朝的德行已经衰微，不管是糊涂人、聪明人，都能看到这一点。天命如果是这样，我怎能违背？”于是诚心归顺杨坚，并将镶有十三道玉环的金带、象征天子的服饰送给高祖，且派李浑入京，举着熨斗对杨坚说道：“希望您执掌权威以安抚平定天下”，杨坚很高兴。

北周大定元年（579年），李穆又以天命为凭据，秘密上表，劝杨坚登基。

杨坚接受禅让后，颁布诏书说：“你曾有旧恩于我，又是我的父辈，恭敬地获悉您的指示，不违大义，定于本月十三日恭顺承接天命。”

开皇元年（581年），李穆来朝见，隋文帝走下廷阶致礼，拜授他为太师，允许他赞拜时不自报姓名，并赐实封成安县三千户食邑。于是，在李穆的子孙中，即便尚在襁褓的，也都拜为仪同，他一家中手执象笏做官的子弟有一百多人。李穆的贵盛，在当时无人可比。

李穆上表请求退休，隋文帝下诏书说道：“我刚刚建立新朝，正要借助良臣的谋略，请求养老这种话，实在不切合您的实际。所谓七十致仕，那是指的一般人。以至于吕尚以八十岁辅佐文王，张苍以满头白发九十奇寿任汉相，卓越的人才为世所用，自然不能拘于平常礼制，请忖度这方面的特例，做一些变通。您既然是年长旧臣，身体不宜过度烦劳，现在可以确定司职，不必参加朝廷集会；如果有重要事，需要商议，则派遣使臣，登门询访。”

隋朝新立之时，太史上奏认为应当迁都。但是隋文帝因为刚刚登基，对此颇为踌躇。

此前，杨坚嫌弃台城地方狭小，而且宫中多有鬼妖。苏威曾劝其迁都，隋文帝没采纳。见太史如此上奏，隋文帝犹豫不决。这时，李穆上表支持迁都。杨坚看到李穆的表章，说：“天道圣明，已有祥瑞显示；太师是人民愿望所归，他提出这一请求，应该可行。”于是听从了李穆的意见。

一年后，隋文帝颁布诏书道：“礼仪制度为一般人而设，智慧超群的人不受此限制；法令律例用来约束小人，对君子不必用法来防范。太师、上柱国、申国公，气度深厚胸襟广大，名望高尚影响深远，在朝廷重臣中名列第一。职位最高，才能卓越，经历无数艰险，犹如钢铁百炼更精纯。如同伯玉一样没有过失，颜回没有异心，且性情清静开阔，本来不会与法律相关。但是圣王传下教诲，是为了表彰善人的。远离法律弘扬道德，是为了尊崇申国公的高龄和功德。从此以后，即使有罪过，只要不是谋反叛逆，纵然有一百个死罪，也不加审问。”

开皇六年（586年），李穆在府第中去世，享年七十七岁。

他在遗嘱中说道：“我承蒙国家大恩，年龄和官爵均已到极点，现在回归黄泉，无所遗憾。到最后我都不能陪天子圣驾到泰山和梁甫去封禅，所以不忍辞世，大概就是因为这一遗恨吧。”隋文帝下诏派遣黄门侍郎监护丧事，赐马四匹，粟麦二千斛，布绢一千匹，并还追赠李穆使持节都督冀、定、赵、相、瀛、毛、魏、卫、洛、怀十州诸军事冀州刺史，谥号为“明”；还赏赐他石椁、前后部羽葆鼓吹、鍂车京车。百官护送他的灵柩到城郭外。隋文帝下诏派遣太常卿牛弘携带哀册，用太牢之礼祭奠。

大业四年（608年），隋炀帝杨广北巡之前，以太牢之礼再次祭奠李穆。

西魏末年，宇文泰率军与北齐军队对阵时，其坐骑受惊，宇文泰坠马险些被擒。李穆急中生智，斥责宇文泰解其困境，并献出自己的坐骑带其突出重围。宇文泰安然脱险，遂有之后北周之兴。

隋朝草创之际，尉迟迥叛乱，派使者前去招揽李穆。虽然有其子李士荣劝其造反，但是李穆不为所动，扣留尉迟迥的使者，坚决支持隋文帝平叛，维护了国家统一和社会安定。

隋朝建立之初，太史及重臣劝隋文帝迁都，杨坚犹豫不决。此时李穆上表果断推动迁都长安，为隋朝之盛耗费苦心。

《周书》：《卷一.太祖本纪》，《卷五.武帝本纪》，《卷七.宣帝本纪》，《卷八.静帝本纪》，《卷三十.列传第二十二》。

《隋书》：《卷一.高祖本纪》，《卷三.炀帝本纪》，《卷三十七·列传第二》，《卷三十八.列传第三》。

《资治通鉴》：《卷一百五十七.梁纪十三》，《卷一百五十七.梁纪十四》。

李富，北魏宁西将军、陇西郡守。

李斌，高平都督。

李文保，追赠司空。

河南元氏，西魏司空、尚书令、留守大都督、冯翊简穆王元季海第三女

李贤，字贤和，柱国大将军、大都督、原州刺史。

李远，字万岁，北周阳平郡公。

李惇，字士献，凤州刺史、安乐郡公。

李怡，仪同三司，追赠渭州刺史。

李雅，北周大将军、开府仪同三司、齐州刺史、大将军、西安县公。

李恒，盐州刺史、阳曲县侯。

李荣，合州刺史、长城县公。

李直，车骑将军、归政县侯。

李雄，柱国、骠骑将军，封爵密国公。

李浑，字金才，隋朝右骁卫大将军、光禄大夫、郕国公。

李询，字孝询，李贤之子，隋朝上柱国、显州总管、陇西襄公

李端，李贤之子，袭父爵。

李崇，字永隆，李贤之子，隋朝幽州总管，赠豫州刺史，谥号为壮。

李植，李远之子，北周相府司录参军、梁州刺史。

李基，字仲和，李远之子，李植之弟，迎娶义归公主，拜江州刺史，追赠使持节、上开府、大将军、曹徐谯三州刺史、炖煌孝公。

李叔谐，李远之子，李植之弟。

李叔谦，李远之子，李植之弟。

李叔让，李远之子，李植之弟。

李孝轨。

李筠，李惇之子，仪同三司、申国公。