已经有近千年历史，建筑宏伟而华丽。由于就在格洛切斯特·格林汽车站旁，它也是很多游客对牛津的第一印象。这座是一座后哥特式建筑，站在尖塔上可以饱览整个牛津的风光。门廊建于1637年，其螺旋立柱是英国建筑史上的一大创新。1645年的战争给门廊留下了弹痕。

圣玛丽教堂早期是各学院的共用教堂，所有的仪式、正式的会议、考试都在这里进行。后来各个学院的活动越来越独立，教堂的作用逐渐弱化。

在13世纪那场著名的大学师生与市民的混战中，国王裁定市民赔偿大学的损失，负担之后500年大学的费用。所以在每年的修士节那天，都会有一队牛津市民代表来到教堂，将赔偿款交给学校的德高望重者。现在这已经成了一种颇富象征意味的仪式。

每个周日上午十点，圣玛丽教堂中都会进行布道。受邀布道的经常都是名人，而讲座的题目却远不限于宗教。