更新时间：2023-02-22 16:49
本站位于罗斯福路、和平东路、和平西路的交叉口，。站名取自现有地名及原站名“古亭”为名，该名称源自“鼓亭”。
采地下三层的岛式叠式月台设计，可进行同月台平行转乘，两个岛式月台分别位于地下第二层与第三层（两月台层间平行重叠），九个出入口。本站与邻近的中正纪念堂站均设计为民防车站，车站天花板到地面街道间有60厘米厚的防爆板，以防止空袭及炸弹破坏。
地下三层车站，站台型式采岛式叠式站台，为同台换乘站[4]，两个岛式站台分别位于地下第二层及第三层两站台层间上下平行重叠，九个出入口，本站设有低站台门。[5]
目前古亭站1号月台号月台为“松山－新店”以及“松山－台电大楼”列车的上行（往松山方向）月台；3号月台则为下行（往新店、台电大楼方向）月台；2号月台为“芦洲--南势角”以及“回龙--南势角”列车的上行（往回龙、芦洲方向）月台、4号月台则为下行（往南势角方向）月台。
出口1～4位于车站南端、出口5～9位于车站北端，无障碍电梯位于出口1。
出口1：同安街（罗斯福路西侧、同安街北侧、只有电梯）
出口2：同安街（罗斯福路西侧、同安街南侧）
出口3：古亭市场（罗斯福路东侧）
出口4：师范大学（罗斯福路东侧、和平东路南侧）
出口5：和平东路一段（罗斯福路东侧、和平东路北侧）
出口6：杭州南路（罗斯福路东侧、杭州南路口）
出口7：国语日报（罗斯福路西侧）
出口8：南昌路、和平西路一段（和平西路北侧、南昌路口）
出口9：大都市国际中心（罗斯福路西侧、和平西路南侧）
已废止的台湾铁路管理局新店线亦曾设有古亭车站，但位置与今台北捷运古亭站不同。