1995年8月—1996年9月，担任华北电力大学副校长、保定校区校长。

1996年9月—1998年6月，担任华北电力大学副校长（保定校区建制撤销）。

1997年，入选国家首批“百千万跨世纪优秀人才”。

1998年6月—2001年1月，担任武汉水利电力大学校长。

2001年1月—2016年11月，担任华北电力大学校长。

2006年—2012年，担任电站设备状态监测与控制教育部重点实验室主任。

2007年，获得华中科技大学教育学博士学位。

2011年，担任新能源电力系统国家重点实验室主任。

2015年，当选为中国工程院院士。

2019年，被聘为华北电力大学人工智能学院名誉院长；1月，暨南大学在珠海校区举行敦聘刘吉臻院士团队暨国际能源学院（筹）、能源电力研究中心揭牌仪式。

中国工程院能源与矿业工程学部副主任，中国新型储能产业创新联盟专家委员会主任委员。

刘吉臻带领团队攻克了行业发展面临的多项关键技术难题，取得了具有开创性、系统性的研究成果。2004年研发成功中国第一套火电厂厂级监控信息系统；2011年主持研发成功中国最大容量1000MW超超临界机组自动化成套控制系统；2013年研发成功世界首台600MW超临界循环流化床机组自动化控制系统。针对中国大规模新能源电力消纳面临的难题，主持国家“973计划”项目，开展燃煤发电与可再生能源协同利用理论与技术研究。创建了“新能源电力系统”国家重点实验室。

根据2021年3月中国工程院网站显示，刘吉臻先后出版学术著作5部，发表SCI论文32篇，EI论文118篇。

根据2021年3月中国工程院网站显示，刘吉臻先后获得国家科技进步二等奖2项（第一完成人）、省部级科技进步奖4项；授权发明专利17项。

根据2021年3月中国工程院网站显示，刘吉臻先后培养了博士研究生36名，硕士研究生68名。

刘吉臻在课堂上没有讲艰深的专业知识，而是结合自己的人生经验，漫谈为人处世和读书治学。他分享了自己求学考研的经历，提醒大家要珍惜大学时光，夯实自己的专业基础知识，养成记笔记等良好的学习习惯，合理分配时间学会自我管理，坚持锻炼身体、读书，不断提升修养。

刘吉臻在大学校长岗位上，注重教育理论的学习与创新实践，明确提出了“遵循教育规律，适应社会需求，突出办学特色，深化教育改革，实现跨越式发展，把华北电力大学建成一所国内一流、国际上有一定影响、具有鲜明特色的多科性、研究型、国际化的全国重点大学”的发展目标。创造性地实施两地办学一体化管理模式，实现了“211工程”建设正式立项。提出了一系列教育改革的思想和措施，推动了学校发展与水平的迅速提升。

刘吉臻政治素质好，对党忠诚，熟悉高校工作规律，领导经验丰富，注意从全局思考问题，公道正派，团结同志，关爱师生，严于律己，赢得了广大师生员工的信任和尊敬，对学校改革发展做出了突出贡献。（教育部党组评）

刘吉臻牢牢把握本学科发展前沿，面向国家重大需求，带领团队埋头苦干，勇于创新，攻克了一次又一次关键技术难题，为解决中国能源电力转型发展中的新能源消纳问题做出了突出贡献。（华北电力大学本科招生信息网评）